Mascot Serverは、質量分析計で測定されたタンパク質あるいはペプチドの質量スペクトルに一致するアミノ酸配列をタンパク質・ゲノムの配列データベースやスペクトルライブラリから検索し、試料に含まれるタンパク質を同定するためのソフトウェアです。以下の質量分析計ベンダーの質量ピークリストを使って検索する事ができます。
- AB Sciex
- Agilent
- Bruker
- Jeol
- Shimadzu
- Thermo Scientific
- Waters
Mascot検索によって検出されたタンパク質またはペプチドは確率的なスコアリングアルゴリズムによって処理され、統計的に有意なタンパク質・ペプチドは期待値（または期待値に対応するスコア）と偽陽性率（FDR）によって明確に区別され、同定されたかどうかを直感的にわかりやすい形式で可視化します。
無料でご利用いただけるMascot検索サーバをインターネット上に公開しています。お客様のWebブラウザからアクセスできますのでお試しください。なお、より多くの方に快適にお使いいただくため、投入できる質量データサイズ等に若干の制限があります。詳しくは FAQページ をご覧ください。
無料Mascot検索サーバー
Peptide Mass Fingerprint
ペプチドイオン質量スペクトルに一致するタンパク質を探します
Ms/Ms Ion Search
プロダクトイオン質量スペクトルに一致するペプチドを探します
Sequence Query
配列タグに一致するペプチドを探します
Mascot検索サーバは、
- Mascot Serverソフトウェア
- Webサーバーアプリケーション（IISあるいはApache）
- ソフトウェアを走らせるPC（WindowsまたはLinux）
で構成されています。Mascot Serverライセンスを購入することにより、お客様のイントラネットワーク環境の中に次のような特徴を持つMascot検索サーバサイトを導入する事ができます。
- 質量データのサイズや量に制限のないMascot検索
- 検索データベース、修飾、消化酵素、定量メソッドを編集・新規構成可能
- ロール形式のユーザ管理機能
- Mascot検索を自動化するためのMascot Daemonソフトウェアを無料バンドル
- 質量分析計解析システム、実験データ管理システムとネットワーク接続可能
- 1ライセンス当たり6コアプロセッサまで動作可能
- マルチCPU、PCネットワーククラスタに対応したスケーラビリティ
また、Mascot Serverライセンスにはオンサイトを含む充実した技術サポートと最新バージョン提供サービス（保守契約）が付属しています。購入から1年間は無償で保守契約が付属しており、その後も有償で保守を継続する事ができます。
